Tous les cod sont placés avant :
Je lui ai parlé d’une façon que j’aurais pensée trop intelligente pour un enfant. j’aurais pensé cette façon=cod.
Il affichait des pectoraux bien dessinés que j’ai toujours pensés réservés aux champions.
C’était une vieille femme que j’ai supposée marocaine.

Sans doute ai-je été trop endurci dans ma jeunesse…(nous avons sans doute été …) : remplacer « je » par « nous » peut parfois aider !

– Je me rappelle mes vacances – tu te rappelles cette histoire ==> tu te la rappelles.
– je me souviens de vous – je me souviens de lui – je m’en souviens

J’adresse un remerciement particulier à M. X et à M. Y qui m’ont ouvert les portes de leurs établissements.
De cette façon, on comprend qu’il y a deux établissements.
Avec le singulier, on peut penser qu’il s’agit d’un seul qui appartient aux deux personnes.

Bonjour, votre texte n’est pas si simple car il y a plusieurs subordonnées enchâssées pour les phrases que vous avez citées.
Par ailleurs, ce site n’est pas un site d’aide aux devoirs…
Désolée.
Étudiez les bases de la structure de phrase en propositions et venez poser une question précise ultérieurement.

Ce site est un site de questions sur l’orthographe et non de correction personnalisée de textes. Pour vous relire, commencez par les verbes à accorder avec le sujet.
Voici deux verbes mal conjugués :
En général les missions et les activités actuelles me plaisent, mais je souhaite pouvoir évoluer vers des missions qui demandent une analyse plus profonde.

A ma connaissance, pas de règle. Lire et retenir le régime des verbes. Parfois, les deux sont possibles : il continue à réfléchir et il continue de réfléchir.
Parfois, il ne faut pas de préposition : il souhaite venir alors que : il refuse de venir.
Je pense à réfléchir est la seule formulation correcte.

Une interrogative indirecte serait : « elle me demande qui est est venu la voir ».
Pour moi, c’est une relative avec un antécédent qui est sous-entendu (la personne/celui qui).

J’aime qui m’aime.
La relative substantive « qui m’aime » est C.O.D. du verbe « J’aime ».

Je pense que l’expression emploie le mot sujet au sens de matière, comme vous l’avez compris.
Comment je m’exprimerais :
– C’est un sujet de discussion intéressant.
– Il n’y a pas matière à discussion.
– Il n’y a pas de sujet à l’ordre du jour.

« y’a pas de sujet », voir cet article.

Pourquoi pas : cela me servira de leçon ? Ce serait moins alambiqué !

Figure par laquelle on exprime un concept au moyen d’un terme désignant un autre concept qui lui est uni par une relation nécessaire (cause et effet, inclusion, ressemblance, etc.).
« Boire un verre »(boire le contenu) est une métonymie.

Je dirais que la locution verbale « prendre le frais » (sous-entendu « de l’air frais ») peut être une métonymie mais c’est à vérifier.