Il a maintenant la quasi certitude que c’est bien cet auditeur, François Salome, qui les lui avait prises, pendant qu’il était sorti de la salle quelques minutes, pour s’entretenir avec un membre de l’équipe auditée.
Voici ma proposition tant pour les pauses que pour la syntaxe.
François Salomé : apposition entre virgules
pendant qu’il était…= complément circonstanciel en milieu de phrase entre virgules.

Bien sûr que c’est
J’ai dit
Ou
Je dis.
Sur les chaînes d’information, il y a beaucoup de fautes.

Seule : doit s’accorder avec « une poignée ».
pense : si vous insistez sur une poignée
pensent : si vous insistez sur le pluriel

si le pronom « en » représente le COD, on n’accorde pas le participe passé. …à moins que vous n’en ayez pas fait. Le subjonctif ne change rien à l’accord. 

J’appliquerais la règle : une robe bleu et noir. Invariabilité de l’adjectif de couleur pour un seul objet bicolore.

Je suis d’accord avec vous.
-> I- La proposition subordonnée relative déterminative essentielle à la compréhension de la phrase. Elle fait partie intégrante du groupe nominal (G.N) et remplit la fonction d’épithète.

Exemple : Les élèves qui travaillent bien réussissent.

-> II- La proposition subordonnée relative explicative qui apporte une précision supplémentaire et peut être supprimée sans que cela modifie le sens du G.N. Elle est en général apposée au G.N antécédent.

Exemple : Voilà la maison où j’habite.

1. Ces visiteurs que j’ai vus descendre les escaliers. Mais : J’en ai vu descendre les escaliers [pas d’accord à cause de « en », bien que les visiteurs soit COD.
2. Ne restent que les retardataires qui nous ont tiré dessus. Nous n’est pas COD
3. Ils nous ont regardés (accord avec « nous » COD placé avant et sujet de l’infinitif) nous éloigner, car nous nous étions jeté tant d’insultes. Pas d’accord avec « nous » qui n’est pas COD
4. Pour les fourmis, il y en a peut-être cent ou un milliard  cachées ? ici accord avec fourmis semble plus logique.
5. Votre révélation n’a aucune importance, comparée à ce qui va suivre : accord avec  révélation. 
Je mettrais le complément au début : « comparée à ce qui va suivre, votre révélation n’a aucune importance ». C’est la révélation qui est comparée. 
6. Je commence à lire un peu de romans historiques ; le sens est « romans historiques » au pluriel, mais  la formulation « un peu de romans historiques » me paraît surprenante. « Je commence à lire des romans historiques ». 

Ouvrez grands vos yeux.  Grand – bon – frais : accord en tant qu’adverbe
Ni moi ni le service informatique ne méritons votre mécontentement.
Elle est (tout) en joie. Adverbe : invariable

Ils n’en sont pas pourvus : toute votre analyse est bonne, il faut en tirer les conclusions.
Ils sont pourvus de la minutie nécessaire.
Cette maladie : le pays en atteint. 

J’écrirais : elle s’est passée de la mer
Se passer de quelque chose : j’analyserais ce verbe comme un pronominal autonome.C’est un verbe qui a un sens spécifique à la forme pronominale (en effet, le pronom « se » n’est pas analysable). Autrement dit, vous accordez avec le sujet comme les essentiellement pronominaux.
(essentiellement pronominal dans ce sens).