Merci, mis-en-trope, d’avoir pris du temps pour me répondre.
Pour le 3., j’ai du mal à bien saisir, car, sur la BDL, on explique qu’avec un verbe exprimant une durée, le participe passé du verbe passer est invariable : les deux années qu’il a vécu en Egypte et qu’il a passé au Caire ont été formidables. Un participant a établi une différence :  si le temps donné est une période, il y a accord (ex. la semaine qu’ils ont passée ensemble était une belle semaine), mais s’il s’agit d’une durée, il n’y aurait pas d’accord (ex. la semaine qu’ils ont passé ensemble n’a pas suffi à les réconcilier, sept jours c’est trop court). Dans mon exemple : ces deux années que Jean avait passé(es) loin des siens, s’agit-il d’une période ou d’une durée ?

Je vous remercie pour les précisions liées à la question n° 1.
Pour la deuxième question, c’est le b. qui me pose problème, et ça n’est toujours pas très clair…
C’était + nom pluriel… que    OU    c’étaient + nom pluriel… que (?)

Merci beaucoup, mis-en-trope, pour toutes ces informations qui sont très précises, et dont je vais me servir par la suite.
En fait, votre positionnement de virgules est celui auquel je pensais avant de poser la question sur le site.

C’est clairement expliqué. Merci, Joelle.

Je vous remercie pour ces précisions, même si les avis divergent…

Merci à tous pour ces développements.

Merci à Prince pour ses précisions.

Pour la deuxième question, je vous remercie d’avoir pris la peine de faire des recherches. Les miennes, sur les dictionnaires Larousse et Le Petit Robert, n’avaient rien donné. Il est possible que l’auteure ait fait une erreur de saisie (par au lieu de à) et ait voulu dire : « J’ai l’impression d’être confrontée à son regard », avec le sens de devoir faire face au regard de l’autre.

Merci pour ces approfondissements !

Merci pour ces explications du 2 et du 3. Mais, pour le 1., on dit bien : ce n’est pas de ça que j’ai envie (avoir envie de), c’est de ça que j’ai besoin (avoir besoin de), donc : ce n’étaient pas de forêts qu’il s’était entouré (s’entourer de), sinon cela fait de et dont  à la suite : Ce n’étaient pas d’épaisses murailles dont il s’était entouré. Ce n’étaient pas de forêts dont il s’était entouré. Mon raisonnement n’est peut-être pas le bon (…?)