Si on applique strictement la concordance des temps, c’est la plus que parfait.
 Le seul ami qu’elle eût jamais eu s’en alla.

Mais les deux temps du subjonctif, imparfait et plus qu parfait sont de moins en moins employés et il est largement toléré d’employer, à la place, présent et passé.
Le seul ami qu’elle ait jamais eu s’en alla .

Ceci est possible parce que le subjonctif n’a pas une valeur temporelle forte, le temps étant donné par la principale en général. Sa valeur est surtout modale (projection de la pensée).

Quelle sorte de parents peuvent laisser un gamin livré à lui-même ?
Avec des noms tels que genre, espèce, type, sorte, variété, catégorie, classe, forme, etc., suivis d’un complément du nom, l’accord du verbe, de l’adjectif ou du participe passé qui suit se fait généralement avec le complément.

A Les livres que conseillent les professeurs sont tous à la bibliothèque.
Cette phrase complexe a deux phrases de base :
1 Les livres  sont tous à la bibliothèque.
2 Les professeurs conseillent ces livres.
quand on a subordonné la 2 à la 1, on a remplacé ces livres (de la phrase 2), complément d’objet direct du verbe (conseillent) , par un pronom relatif.  Le pronom relatif COD est « que ».

Analyse de votre phrase (A)  :
les livres : sujet du verbe être
que : COD du verbe conseiller
les professeurs : sujet du verbe conseiller
tous : adjectif indéfini se rapportant à livres
bibliothèque : complément de lieu du verbe être

Grâce à la lettre qu’a écrite Sylvie…. (phrase inachevée)
« Que » est le COD. C’est un pronom qui remplace « lettre ».
J’écris une phrase complète pour pouvoir expliquer : Grâce à la lettre qu’a écrite Sylvie il a pu obtenir cet emploi de jardinier.
Les deux phrases de base sont
– Grâce à la lettre  il a pu obtenir cet emploi de jardinier.
– Sylvie a écrit cette lettre

« Cette lettre » qui a la fonction de COD  a été remplacé par le pronom (relatif) « que »  qui prend sa fonction, mais aussi son nombre et son genre.
Le participe passé « écrite » étant accompagné de l’auxiliaire avoir s’accorde avec lui, parce qu’il est placé avant

Je te laisserai dormir – je laisserai Hélène dormir

On a là deux propositions : je laisserai : proposition principale
te (>toi) /Hélène dormir : proposition infinitive (subordonnée) COD

–> « te » appartient à la proposition infinitive : il est l’agent du verbe « dormir »

On peut choisir, pour formuler une injonction, différents temps, à l’écrit comme à l’oral :
– l’impératif : il est direct et fait du lecteur un interlocuteur : indiquez la classe de marchandises.
– le futur aussi s’adresse directement à la personne concernée, mais, en projetant artificiellement (ou pas) le fait, il y a adoucissement de l’injonction (politesse le plus souvent, mais fermeté) : vous indiquerez la classe de marchandises.
– le présent évite que l’ordre soit trop direct mais donne à  l’injonction une nuance d’autorité comme si elle était déjà suivie d’effet : vous indiquez la classe de marchandises.

Et à l’écrit seulement, l’infinitif : l’injonction se fait impersonnelle, et prend la forme d’une règle à suivre : indiquer la classe de marchandises.

Dans le cas que vous citez l’impératif et l’infinitif sont possibles.

Une robe d’hiver s’oppose à une robe d’été, une robe de soirée, une robe de chambre, une robe de mariée, une robe de plage : il s’agit d’une sorte de robe et le complément du nom est donc restrictif. Les compléments du nom restrictifs s’emploient sans déterminant :
une cuillère à dessert/une cuillère à soupe/une cuillère à café
un chapeau de marin/de paille/ cow-boy ..

Alors que dans les joies de l’hiver le complément du nom est simplement descriptif

C’était dans une grange abandonnée qu‘elle avait passé la nuit précédente.
Ce n’est pas une phrase complexe. Il n’y a  qu’une seule proposition  : elle avait passé la nuit précédente dans une grange abandonnée.
L’élément « dans une grange abandonnée » -complément circonstanciel de lieu- est mis en relief par le présentatif « c’est … que » (c’était…que)

Subordonnants composés suivis du subjonctif ou de l’indicatif | BDL

Un article qui répond à votre question, il me semble.

Après non pas que, on emploie le subjonctif, l’indicatif ou le conditionnel

Je simplifie en transformant la phrase :
1 a Il ne pourra plus jamais l’entendre. Non pas qu’il m’aurait écoutée si je lui avais parlé : conditionnel passé
1 b Il ne pourra plus jamais l’entendre. Non pas qu’il m’eût écoutée si je lui avais parlé : ici on utilise le conditionnel passé 2e forme* (qui est emprunté au subjonctif passé)
En effet dans cette phrase,  on est dans l’irréel du passé et c’est bien le conditionnel qui est le mode de l’irréel.
—
Pour la suite de la phrase :
à moins que je ne lui eusse hurlé en pleine face : cette fois-ci, il s’agit bien du subjonctif après « à moins que », pour marquer une restriction
et qu’il eût été attaché pour que je me sentisse en sécurité : même chose après « à moins que » et toujours subjonctif après « pour que »

*Remarque: ce qui peut troubler la réflexion et faire qu’on ne sache plus s’il fallait un conditionnel ou un subjonctif, c’est l’utilisation du conditionnel 2e forme dans la première phrase (1a t 1b))

—-
dans d’autres cas on aura le subjonctif ou l’indicatif après non pas que :
Je le tiens attaché, non pas qu’il puisse vous attaquer : fait futur envisagé (pour le nier).
Je le tiens attaché, non pas qu’il est méchant mais parce qu’il est impressionnant (fait nié au profit d’ un autre fait réel))

On avait déjà répondu dans ce sens à ImreSimon.  Dans le cas d’une impression d’oralité à rendre, les points de suspension sont plus indiqués que les virgules.