Bonjour Concorde,

Cette expression, je l’utilise moi-même beaucoup et cela ne me gêne pas.
Peut-être que cette réflexion peut vous aider à comprendre pourquoi nous l’employons aussi souvent :

Je dis : « merci de m’avoir écoutée » alors que selon votre raisonnement, il faudrait dire : « merci d’avoir écouté ce que j’ai dit ».
De la même manière que pour lu(e), on ne lit pas une personne on lit ce qu’elle a écrit, il me semble donc logique qu’on n’écoute pas une personne mais plutôt ce qu’elle dit.

Pourtant, on dit bien : « merci de m’avoir écoutée », non ?

Comme le sens de « merci de m’avoir écoutée » est très proche de « merci de m’avoir lue » (le contexte est identique), j’ai pris cet exemple. J’espère que cela pourra aider.
Bien cordialement,