Typographiquement, il faut différencier ce qu’on appelle une « enseigne » des autres formes d’écriture d’un nom de société ou d’organisme.
Dans le premier cas, on se réfère à  ce qui est affiché publiquement sur un panneau, en lettres lumineuses, gravé dans la pierre, etc.  Le code est donc d’utiliser l’italique pour ce qui est cité, en respectant l’original, graphie (voire erreurs et bizarreries) comprise : « Il décida de déjeuner au Bistro des universités. » C’est bien cette enseigne qui figure au-dessus de la porte, le gérant l’assume.
Dans les autres cas, on suit le format habituel : « Ce troquet était devenu le principal bistro des universités du secteur. »
Pour mémoire, les noms légaux des sociétés ou établissements sont souvent exprimés différemment mais comportent la mention à l’enseigne de… suivie justement du nom public.