Personnellement, la tournure « au croisement entre  » me paraît inappropriée.
On dira plutôt « au croisement de« .
Définition du dictionnaire de l’Académie :
Croisement : Intersection de deux voies ; lieu où elles se croisent. Ce village est au croisement de deux routes nationales.
Aussi, pour votre titre, je propose :
Le port urbain, au croisement des navigations maritime et fluviale
Ou bien
Le port urbain, entre navigation maritime et fluviale