Les référents donnent ces deux locutions comme équivalentes.
Le dictionnaire de l’Académie donne ceci :
En bas, dans un lieu situé en dessous d’un autre, à la partie inférieure d’un objet.
Loc. prép. Au bas de, au pied de, dans la partie inférieure de. Au bas de la colline, de la rue. Apposer sa signature au bas d’une page. Il y a une note au bas de la page.
Voir ICI  

Ces deux locutions prépositionnelles sont équivalentes.
Tout au plus peut-on rappeler que l’usage de l’article défini renvoie normalement à un objet défini par le contexte :
– les notes en bas de page (généralité) ;
– les notes en bas de la page (celle que vous lisez en ce moment).