S’agissant d’une construction concessive, l’utilisation du subjonctif s’impose effectivement. Mais afin de faire concorder les temps, le subjonctif imparfait doit être utilisé, la principale étant au passé composé ; « fût-il » est donc la formulation adéquate.

Il leur a été/était/avait été/fut impossible d’en prélever un seul morceau, aussi infime fût-il
Il leur est impossible d’en prélever un seul morceau, aussi infime soit-il

Dans une phrase au passé (quel que soit le temps du passé) le temps du subjonctif correspondant est le subjonctif imparfait.
Dans une phrase au présent le temps du subjonctif correspondant est le subjonctif présent.