Bonjour,

dans votre phrase les graines reprises par le pronom qui sont le sujet. Elles commandent la conjugaison : les graines (qui) ont poussé. Pousser est ici intransitif, conjugué avec l’auxiliaire avoir, son participe passé est invariable.

J’ai dessiné les graines qui ont poussé.

Nous avons deux propositions
J’ai dessiné les graines et qui ont poussé : un mot ne peut pas avoir une fonction dans deux propositions à la fois.
Graines est COD du verbe dessiner et c’est tout
qui est sujet du verbe pousser

« Qui » est pronom (relatif) évitant la répétition de « graines » (appelé son antécédent), et reliant les deux propositions.  Il prend son genre et son nombre.
Le verbe « pousser » n’a pas de COD. Aucun accord à envisager pour son participe passé donc puisqu’il est conjugué avec l’auxiliaire « avoir ».