Un bout de réponse : voir la polysémie de « avoir ».
1 Qu’est-ce qu’elle a ?
2 Qu’est-ce que ta fille a ?
Pour une raison ou une autre (voir plus bas) la 2 fait davantage porter l’accent sur le verbe avoir et ce verbe prend alors le sens de posséder, ce qu’il n’ a pas forcément avec le pronom.
Qu’est-ce qu’il a ? réponse : il est malade – il est contrarié…
On pense d’abord que la question porte sur l’état, ou bien on donne un complément à « avoir » >> Qu’est ce qu’il a dans les mains?
Qu’est-ce que ta fille a ? réponse possible : elle a une boîte de chocolats.
On pense d’abord que la question porte sur la possession, d’où la reformulation : qu’est-ce qu’elle a, ta fille ?

—> pourquoi alors cette différence entre pronom et nom ?
Je ne vois pour ma part qu’une raison : la fréquence de l’emploi de la formulation  avec le pronom, parce que cette formulation appartient à l’oral et qu’on a plus rarement besoin du nom. En situation, le pronom suffit généralement.