Bonjour,

Après COMPRENDRE QUE…, le subjonctif est de règle quand « comprendre » signifie : « admettre que, être sensible au fait que, approuver que. »
Ex. : Je comprends qu’il ne puisse pas s’absenter en ce moment. Nous comprenons que vous souhaitiez un emploi plus actif. M. N…  comprendra certainement que nous désirions le rencontrer le plus tôt possible.

Cependant, l’indicatif est correct après COMPRENDRE QUE dans les conditions suivantes :
– quand comprendre a le sens de « saisir, interpréter, compter que, avoir dans l’idée que » ;
– quand comprendre est à un temps passé ;
–  quand comprendre est suivi de bien.
Ex. : J’ai bien compris que cette lettre ne doit (devait) pas être envoyée avant mardi.
Nous avons bien compris que vous désirez prendre une participation dans cette affaire.
Vous comprenez bien que nous ne pouvons pas accepter une telle demande.  »

CELLARD,  Le subjonctif. Comment l’employer ? Quand l’employer ? Duculot.