Je ne les avais pas vu(E)s  depuis très longtemps » telles ont été les phrases que X  avait récemment prononcéES devant les médias (…)

il faut peut-être corriger les fautes d’accord puis donner plus de contexte.
En effet, le plus-que-parfait marque l’antériorité au passé, donc a priori, ce n’est pas adapté à votre rédaction. Pourquoi ? parce qu’il n’y a pas d’action passée servant de référence.