Ce que nous voulons, c’est que cela cesse
Cette phrase est de forme emphatique.

La phrase de base est : nous voulons que cela cesse
Analyse de la phrase de base :
nous voulons : proposition principale
que cela cesse : proposition subordonnée conjonctive introduite par la conjonction de subordination « que » : COD (on l’appelle complétive)
On a rajouté pour l’emphase (l’insistance, si vous voulez) :  ce que… c’est
On peut s’arrêter ici pour l’analyse.

S’il faut absolument analyser la phrase emphatique, voici quelques éléments :
On peut souligner que le pronom démonstratif « ce »  (repris par c’)  a une relative « que nous voulons », a  un attribut « que cela cesse » introduit auprès de lui par le verbe « être »

Remarque : le premier que est pronom relatif – le deuxième est conjonction introduisant un subjonctif