On ne saura jamais ce qu’elles se sont dit.
Le verbe « dire » a ici un COD : que, pronom relatif reprenant le pronom neutre « ce ». Il est placé avant le verbe et donc l’accord du participe passé se fait. Cela ne se voit pas puisqu’on accorde au masculin singulier.
Si on remplace « ce » par « les choses », l’accord apparaît :  On ne saura jamais les choses qu’elles se sont dites.
Par « l’histoire » : On ne saura jamais l’histoire qu’elles se sont dite.

L’accord ne se fera jamais avec le sujet « elles » bien que le verbe soit conjugué avec l’auxiliaire « être » parce qu’il a un COD. en ce cas  on suit la même règle d’accord du PP qu’avec avoir.
L’accord ne se fera pas non plus avec le pronom « se » car il est COI et donc n’infère pas dans la règle.