J’ai dessiné les graines qui ont poussé.

Nous avons deux propositions
J’ai dessiné les graines et qui ont poussé : un mot ne peut pas avoir une fonction dans deux propositions à la fois.
Graines est COD du verbe dessiner et c’est tout
qui est sujet du verbe pousser

« Qui » est pronom (relatif) évitant la répétition de « graines » (appelé son antécédent), et reliant les deux propositions.  Il prend son genre et son nombre.
Le verbe « pousser » n’a pas de COD. Aucun accord à envisager pour son participe passé donc puisqu’il est conjugué avec l’auxiliaire « avoir ».