Bonjour,

En fait il ne s’agit ni de l’un ni de l’autre.
Changer de verbe, par exemple contenir
Vous écrirez alors :
« Vérifiez que votre ordinateur contient tous les logiciels » (et non contienne)
Dans ce contexte le verbe vérifier impose que le verbe de la complétive soit à l’indicatif.

Il faut donc écrire:
« Vérifiez que votre ordinateur a tous les logiciels.

Sur les emballages des produits alimentaires on peut lire:
« Vérifiez que la date de péremption n‘est pas dépassée.»