Morts étant un adjectif, il s’accorde avec le nom ou le pronom auquel il se rapporte. Aussi,
Vous le mettrez au pluriel.
Une fois morts, ils seront présents dans notre mémoire.
Sur le plan syntaxique, «une fois morts» étant une proposition adjectivale, et donc sans sujet explicite, il faut que le sujet de la proposition suivante soit aussi le sujet de ladite proposition.
Donc, il est souhaitable de structurer votre phrase autour du sujet «ils» qui réfère à une fois morts.