Vos remarques sont justes d’un point de vue grammatical, néanmoins, pour des questions de rythme et de sonorité, « n’était-elle donc peuplée » est – dans le contexte précis du texte – moins agréable à l’écoute que « n’était donc t-elle peuplée ».  Je réitère donc ma question: en faisant abstraction de vos réticences pour cette formulation, dois-je mettre un « t- » avant « elle?