La réponse est dans la question, puisqu’elle regarde dans la direction. L’homme pointe donc aussi du doigt dans la direction…
« Que » n’est pas adapté, car on pointe du doigt un objet, mais pas une direction.
Une direction n’est pas un lieu, donc « où » n’est pas adapté non plus. A la limite, on peut dire : « Elle regarde là où l’homme pointe du doigt. »
La phrase correcte serait donc « Elle regarde dans la direction dans laquelle l’homme pointe du doigt. » Nous sommes d’accord, c’est moche. Il faut donc reformuler. Par exemple « Elle regarde dans la direction indiquée par l’homme », « dans la direction que l’homme indique du doigt », etc.