» Il avait perdu presque toutes ses dents. Le peu qui lui restait / restaient étaient toutes noires.  »

Quand on peut remplacer « le peu de » par « l’insuffisance de », on fait l’accord avec  « peu » : verbe au singulier, adj. et PP au masc. sing.

Quand « le peu de » a le sens de « la quantité faible  de« , on accorde avec le nom : le peu de lettres que j’ai reçu me décourage« . « Le peu de ressources qui existent sont suffisantes. »

Jean Girodet, Dictionnaire Bordas des pièges et difficultés de la langue française, 1988, p. 588.

Conclusion : on écrira :  Il avait perdu presque toutes ses dents. Le peu [de dents] qui lui restaient étaient toutes noires.  »
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