Il me semble que les deux tournures conviennent, tout dépend du contexte :
Si vous parlez dans l’absolu  :
Quand elle prend ses distances et se referme comme une huître, on se sent seul et incapable de l’aider.
Si vous parlez de quelqu’un au sein d’un groupe de personnes (par exemple une bande d’amis), le pluriel s’impose :
Quand elle prend ses distances et se referme comme une huître, on se sent seuls et incapables de communiquer avec elle.

Malgré tout, l’adjectif « seul » me semble ne pas convenir ici, je ne vois pas de lien entre sa mise à l’écart (auquel cas c’est elle qui se sent seule) et votre sentiment de solitude.
Peut-être que « rejeté » ou « accusé » conviendraient mieux ?