Pour « en fleur(s) »,  le TLFi (Académie) rappelle la nuance entre singulier et pluriel :
En fleur (au sing.), lorsqu’il s’agit de fleurs de la même espèce : arbre, pommiers en fleur; en fleur signifie : « dans le temps de la floraison ». En fleurs (au plur.), lorsqu’il s’agit de différentes espèces de fleurs : une prairie, un verger en fleurs; en fleurs évoque la multiplicité de fleurs, d’où le pluriel.

Pour en bouton(s), il n’y a pas de nuance de sens et on trouve couramment les deux. Mais personnellement, je pencherais pour le singulier car là encore on évoque l’état et non le nombre.