Bonjour,

Il a commencé est au passé composé et décrit simplement une action qui s’est produite dans le passé (il y a trois jours, ou deux cents ans, ou cinq minutes) et qui est maintenant terminée : il a fait ses devoirs, Victor Hugo a écrit Les Misérables, je suis tombé dans l’escalier (ce qui est bien le cas dans votre exemple puisque même si l’action commencée n’est pas terminée, la personne n’est plus en train de la commencer). Il avait commencé est au plus-que-parfait, ce temps est utilisé dans un récit au passé pour décrire un événement qui s’est produit (et terminé) avant le moment où se passe l’une des actions du récit : Il s’était levé tôt et préparait son petit déjeuner lorsqu’il entendit la nouvelle à la radio (ici préparer le déjeuner et entendre la nouvelle sont simultanés, par contre il s’était levé tôt s’est passé et terminé avant ces deux actions).

Pour votre autre question, les deux formes sont grammaticalement correctes, dans le premier cas ci-joint est adverbe et invariable, dans le second il est adjectif et se rapporte à ma lettre avec laquelle il s’accorde en genre et en nombre. Il est cependant plus usuel d’utiliser la première forme (ci-joint utilisé comme adverbe pour signifier ici).