L’Académie française apporte la réponse suivante :
« Remercier de est la construction classique du verbe, mais il faut remarquer que remercier pour s’est répandu dans l’usage. L’hésitation entre les deux constructions répond à l’incertitude du statut grammatical du complément, perçu comme un complément d’objet ou comme un complément adverbial marquant la cause. La construction du verbe subit, de plus, l’influence des autres formules de reconnaissance comme « faire, exprimer des remerciements » qui se construisent avec pour. Il en va de même pour merci.

On constate aujourd’hui que l’on emploie plus souvent remercier de avec un infinitif et remercier pour avec un substantif. »