Syntaxiquement les trois formulations sont correctes.

Mais on dirait plutôt :   J’ai apprécié vos compliments et je vous en remercie. – « Vos compliments sont appréciés, merci. » pourrait se trouver dans un contexte spécifique mais cette formulation n’est pas celle qu’on utilise spontanément.

Les deux adjectifs ont des sens différents :
appréciable signifie : « qui peut être apprécié » (le suffixe -able signifie : « qui peu »t)
apprécié indique un fait avéré.