Encore une fois les deux sont possibles, cela dépend du degré d’incertitude. La phrase dont la subordonnée est au subjonctif souligne une incertitude plus grande  que l’autre.
Phrase 1 : La principale seule exprime déjà un degré d’incertitude.
J’aime à croire que « battus » a été correctement accordé.
Phrase 2 : la subordonnée ajoute un degré d’incertitude.
J’aime à croire que « battus » ait été correctement accordé.

Ce choix de nuances que peut faire l’énonciateur souligne la richesse de notre langue.