« Se mettre accroupi » n’est pas une tournure très heureuse. En bon français on dira « Impossibilité de s’accroupir« .
Si la position dure (dans le temps), on peut dire « se tenir accroupi / rester accroupi« .

Si l’expertise porte sur un lieu où l’on ne peut pas s’accroupir, on optera pour l’accord neutre :
L’expert a relevé une impossibilité de s’accroupir / de se tenir accroupi / de rester accroupi.

Maintenant, s’il s’agit d’une expertise médicale concernant une ou plusieurs personnes, on accordera en genre et en nombre :
Se tenir accroupie / accroupies / accroupi / accroupis.