Il a des yeux bleu clair : c’est le bleu qui est clair : l’adjectif qualifiant toujours un nom, bleu (= le/ce/un bleu) est un nom.
Il a des yeux bleus,  clairs. ce sont les yeux qui sont clairs. Le nom yeux a deux adjectifs : bleus et clairs.

On met une virgule ou une conjonction entre deux adjectifs qui se suivent : le temps et chaud, sec – le temps est chaud et sec. (On n’écrira pas : le temps est chaud sec).
A l’oral, il y a une pause légère entre les deux adjectifs.

Remarques :
– Il n’y a pas de virgule entre le nom et son épithète : un chapeau melon (et non un chapeau, melon) un bleu clair (et non un bleu, clair)
– et en effet, l‘adverbe n’y change rien.  Dans les deux cas il s’applique à clair/clairs, que cet adjectif se rapporte à l’un ou l’autre nom (yeux ou bleu)