La construction « rendez-vous(-)en compte » est plus régulière. À l’impératif affirmatif, le pronom du verbe pronominal, réfléchi ou autonome, précède en général les autres compléments notamment en et y.
Autres exemples : 
– Emparez-vous-en !
– Rappelez-vous-le !
– Mets-t’y ! (selon l’Académie)
Cela n’est valable que pour les verbes pronominaux puisque la construction normale du verbe transitif place le complément direct avant les autres compléments :
– Rappelez-le-nous !
– Donne-le-moi !
NB le trait d’union entre les deux pronoms n’apparait que si le second pronom est isolé (non suivi d’un verbe à l’infinitif en particulier). Vous pouvez lire la note de l’Académie à ce sujet mais elle n’est pas claire dans le cas de locutions verbales comme se rendre compte.