Comme expliqué dans les autres réponses, les deux modes (indicatif ou subjonctif) peuvent se concevoir.
Il ne faut en oublier pour autant d’accorder le verbe de préférence avec le pronom sujet, même si l’usage et certains grammairiens, dont Grevisse, se montrent très tolérants  à cet égard :
– Nous sommes les seuls (ceux, quelques-uns) qui avons travaillé dur ;
– Vous êtes  les seuls qui avez (ayez) travaillé dur ;
Donc :
– Tu es le seul qui as (aies) travaillé dur.
NB Idem avec le premier, le dernier, l’unique.