On écrit comme se fait-il.  C’est la forme contractée de l’expression « comment cela se fait ? Comment cela se fait-il ?
Il se fait quoi ?

Ce est un pronom démonstratif qui ne peut pas être employé dans la forme pronominale d’un verbe, ici  » se faire ».

On ne trouvera jamais °comment ce fait-il ?

Comment se fait-il ? la phrase interrogative  inverse sujet-verbe : et correspond à la déclarative :  il se fait.
On a là une tournure impersonnelle de forme pronominale  comme  il se trouve ! il se trouve que c’est lui le coupable – il se passe : il se passe beaucoup de choses étranges.
Le sujet impersonnel « il » est repris par le pronom impersonnel COD « se » qui correspond aux autres pronoms, personnels ceux-là :  me , te, se, nous, vous, se.
exemples :
je me lève – tu te lèves – il se lève, etc.

Ce est : soit un déterminant : ce voyage m’enchante
Soit un pronom démonstratif : voilà ce que j’aime qui peut être remplacé par « la chose » : voilà la chose que j’aime.
Ce que j’affirme est important = la chose que j’affirme est importante.