Bonjour Alicia2.

Le subjonctif exprime une possibilité, une hypothèse alors que l’indicatif indique une réalité.

La phrase que vous citez exprime un fait avéré : son père s’en souvient, c’est une réalité. On utilisera l’indicatif : il n’y a que mon père qui s’en souvient.

En revanche, à la forme interrogative, la question est posée et la réponse n’est pas connue avec certitude, et le subjonctif s’impose : est-ce qu’il n’y a que mon père qui s’en souvienne ?