Ce sujet est trop vaste pour être traité en intégralité ici. Les règles sont nombreuses et parfois délicates. Je vous propose de lire le chapitre ad hoc  de mon ouvrage de prédilection, Orthotypographie  de Jean-Pierre Lacroux. Il a l’avantage de répertorier dans chaque règle les variantes d’autres ouvrages de référence.

Vous pouvez bien entendu revenir à tout moment pour une question plus précise. Bonne lecture !