Attention elvyne77, je synthétise.

Selon Ouatitm :
— Il faut écrire « je suis content que tu sois là », car après « je suis content que », on met le subjonctif.

Selon Tara (résumé de sa réponse ci-dessus et des cinq précédentes sur le subjonctif) :
— Ah mais c’est beaucoup plus complexe, on ne peut pas répondre aussi vite. Si je suis sûre que tu es là, et que je suis contente, alors cela veut dire « tu es là et je suis contente » et donc les deux faits sont deux réalités alors que le subjonctif est le mode de l’irréalité ou de l’incertitude, et comme je te vois là et que ta présence est une réalité avérée il faut dire « je suis contente que tu es là », car c’est selon le degré d’incertitude, de volonté ou d’hypothèse qu’on choisit les modes, et c’est ce qui fait la richesse du français.

Je ne ne vous cache pas que la réponse de Ouatitm est la plus conforme à l’usage, tant populaire que littéraire.

Ce qui rend la réponse à votre question un peu complexe, c’est la structure « ce qui…, c’est que… », qui sans doute offre plusieurs approches, et qui peut-être permet une rupture syntaxique par effet de style, pourquoi pas, ou plus probablement libère le second verbe du premier, ou que sais-je encore…
Mais si vous parlez du fait que le gars soit là, et si ce fait joue un rôle de sujet dans votre phrase, utilisez le subjonctif :
— Que tu sois là (et non que tu es là), c’est important, je le souhaite, je m’en réjouis…
— Que tu sois là (et non que tu es là), c’est ce qui compte pour moi.
— Que tu sois là compte pour moi.
— Ce qui compte pour moi est que tu sois là.
Si votre phrase en « Tout ce qui… c’est… » a un autre sens que celui de la phrase ci-dessus, explicitez-le.