Bonsoir,
Lorsque le COD (que mis pour plainte) a un attribut (agressive) et que le participe passé (cru) est suivi de cet attribut, l’accord du participe passé se fait généralement avec le COD placé devant lui, mais l’invariabilité est admise.
On écrira donc : c’est une véritable plainte, que j’avais crue d’abord agressive .
Mais on peut aussi ne pas accorder cru : c’est une véritable plainte, que j’avais cru d’abord agressive.