Il l’en a sortie.
« En » a plusieurs natures. Ici il est pronom ayant pour antécédent un nom.
Marie était enfermée dans la pièce. Il l‘en a sortie = il l’a sortie de cette pièce.
« En » et « pièce » sont ici compléments circonstanciels de lieu.
Le cod dans « il l’en a sortie » est |l’| qui est pronom personnel reprenant « Marie ». C’est avec lui que se fait l’accord du participa passé construit avec l’auxiliaire avoir, puisqu’il est placé avant le verbe. Comme « Marie » est singulier féminin, |l’| est aussi féminin singulier.
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« En » peut avoir d’autres fonctions et notamment : Je mange des pommes. Il en a mangé = il a mangé certaines des pommes
C’est en ce cas qu’on ne fait pas l’accord  (ce qui pourrait se discuter mais c’est ainsi).
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« En » peut aussi être préposition : Cette table est en bois.